一、 企业贯彻ISO9001标准，根据标准编制企业体系文件。
最高管理者应先在企业内部贯彻ISO9001标准，使得企业员工有一定的质量意识，能够更好的配合进行下一步的工作。企业也可以借助外部力量来贯彻ISO9001标准，贯标一般采用培训的形式。 体系文件一般包括质量手册、程序文件、规章制度、工艺文件、作业指导书、检测规程及各类记录表格。这些文件应覆盖到ISO9001标准的全部内容，并可能会不断修改以适应企业实际情况。
二、体系运行，内部审核，管理评审。
企业的体系文件制定之后，应根据文件要求运行体系，并保留相关记录。体系运行一段时间后应进行内部审核及管理评审，保留相关记录。以上所有的记录都是认证现场审核时应提供的证据。  
三、现场审核，不符合整改，颁发证书。 当企业体系运行三个月（特殊行业六个月）之后，可以向认证机构申请ISO9001质量管理体系认证，认证机构会根据相关要求安排现场审核。现场审核结束后，审核组会出具体系运行的不符合项，要求企业整改。整改完成后，就可以进入颁发证书的程序。